Protein–RNA interactions for Protein: Q2Y0W8

SLC4A8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A8Q2Y0W8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC4A8Q2Y0W8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A8Q2Y0W8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A8Q2Y0W8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A8Q2Y0W8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A8Q2Y0W8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A8Q2Y0W8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A8Q2Y0W8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC4A8Q2Y0W8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A8Q2Y0W8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A8Q2Y0W8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A8Q2Y0W8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A8Q2Y0W8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A8Q2Y0W8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A8Q2Y0W8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC4A8Q2Y0W8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SLC4A8Q2Y0W8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A8Q2Y0W8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A8Q2Y0W8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A8Q2Y0W8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A8Q2Y0W8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A8Q2Y0W8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A8Q2Y0W8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A8Q2Y0W8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A8Q2Y0W8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A8Q2Y0W8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A8Q2Y0W8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A8Q2Y0W8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A8Q2Y0W8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC4A8Q2Y0W8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC4A8Q2Y0W8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC4A8Q2Y0W8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC4A8Q2Y0W8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms