Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL38Q2WGJ6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
KLHL38Q2WGJ6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLHL38Q2WGJ6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms