Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

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Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP5B1Q2VPB7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AP5B1Q2VPB7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP5B1Q2VPB7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP5B1Q2VPB7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
AP5B1Q2VPB7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP5B1Q2VPB7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP5B1Q2VPB7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP5B1Q2VPB7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP5B1Q2VPB7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP5B1Q2VPB7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP5B1Q2VPB7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP5B1Q2VPB7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP5B1Q2VPB7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP5B1Q2VPB7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP5B1Q2VPB7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP5B1Q2VPB7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP5B1Q2VPB7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP5B1Q2VPB7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AP5B1Q2VPB7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP5B1Q2VPB7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AP5B1Q2VPB7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AP5B1Q2VPB7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AP5B1Q2VPB7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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