Protein–RNA interactions for Protein: Q29980

MICB, MHC class I polypeptide-related sequence B, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICBQ29980 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MICBQ29980 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MICBQ29980 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MICBQ29980 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MICBQ29980 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MICBQ29980 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MICBQ29980 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MICBQ29980 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MICBQ29980 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MICBQ29980 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MICBQ29980 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MICBQ29980 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MICBQ29980 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MICBQ29980 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MICBQ29980 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MICBQ29980 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MICBQ29980 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MICBQ29980 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MICBQ29980 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MICBQ29980 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MICBQ29980 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MICBQ29980 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MICBQ29980 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MICBQ29980 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MICBQ29980 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MICBQ29980 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MICBQ29980 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MICBQ29980 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MICBQ29980 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MICBQ29980 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MICBQ29980 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MICBQ29980 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MICBQ29980 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MICBQ29980 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MICBQ29980 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MICBQ29980 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MICBQ29980 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MICBQ29980 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MICBQ29980 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MICBQ29980 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MICBQ29980 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MICBQ29980 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MICBQ29980 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MICBQ29980 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MICBQ29980 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MICBQ29980 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MICBQ29980 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MICBQ29980 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MICBQ29980 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MICBQ29980 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MICBQ29980 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MICBQ29980 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MICBQ29980 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MICBQ29980 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MICBQ29980 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MICBQ29980 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MICBQ29980 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MICBQ29980 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MICBQ29980 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MICBQ29980 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MICBQ29980 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MICBQ29980 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MICBQ29980 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MICBQ29980 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MICBQ29980 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MICBQ29980 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MICBQ29980 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MICBQ29980 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MICBQ29980 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MICBQ29980 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MICBQ29980 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MICBQ29980 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MICBQ29980 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MICBQ29980 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MICBQ29980 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MICBQ29980 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MICBQ29980 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MICBQ29980 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MICBQ29980 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MICBQ29980 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MICBQ29980 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MICBQ29980 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MICBQ29980 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MICBQ29980 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MICBQ29980 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MICBQ29980 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MICBQ29980 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MICBQ29980 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MICBQ29980 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MICBQ29980 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MICBQ29980 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MICBQ29980 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MICBQ29980 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MICBQ29980 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MICBQ29980 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MICBQ29980 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
MICBQ29980 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MICBQ29980 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MICBQ29980 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MICBQ29980 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms