Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN21Q16825 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN21Q16825 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN21Q16825 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
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