Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FSCN1Q16658 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FSCN1Q16658 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FSCN1Q16658 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FSCN1Q16658 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FSCN1Q16658 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FSCN1Q16658 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FSCN1Q16658 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FSCN1Q16658 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FSCN1Q16658 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FSCN1Q16658 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FSCN1Q16658 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FSCN1Q16658 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FSCN1Q16658 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FSCN1Q16658 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FSCN1Q16658 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FSCN1Q16658 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FSCN1Q16658 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FSCN1Q16658 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FSCN1Q16658 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FSCN1Q16658 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FSCN1Q16658 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
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