Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMN1Q16637 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMN1Q16637 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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