Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCSK7Q16549 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCSK7Q16549 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCSK7Q16549 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms