Protein–RNA interactions for Protein: Q15907

RAB11B, Ras-related protein Rab-11B, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11BQ15907 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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RAB11BQ15907 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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RAB11BQ15907 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RAB11BQ15907 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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RAB11BQ15907 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
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RAB11BQ15907 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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RAB11BQ15907 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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RAB11BQ15907 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB11BQ15907 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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