Protein–RNA interactions for Protein: Q15782

CHI3L2, Chitinase-3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L2Q15782 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHI3L2Q15782 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHI3L2Q15782 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms