Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CNN3Q15417 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CNN3Q15417 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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