Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LAPTM4AQ15012 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LAPTM4AQ15012 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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