Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RASGRF1Q13972 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RASGRF1Q13972 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RASGRF1Q13972 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RASGRF1Q13972 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RASGRF1Q13972 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RASGRF1Q13972 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RASGRF1Q13972 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RASGRF1Q13972 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RASGRF1Q13972 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RASGRF1Q13972 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RASGRF1Q13972 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RASGRF1Q13972 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RASGRF1Q13972 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RASGRF1Q13972 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RASGRF1Q13972 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RASGRF1Q13972 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RASGRF1Q13972 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RASGRF1Q13972 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RASGRF1Q13972 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RASGRF1Q13972 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RASGRF1Q13972 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RASGRF1Q13972 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RASGRF1Q13972 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RASGRF1Q13972 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RASGRF1Q13972 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RASGRF1Q13972 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RASGRF1Q13972 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RASGRF1Q13972 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RASGRF1Q13972 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RASGRF1Q13972 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RASGRF1Q13972 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RASGRF1Q13972 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RASGRF1Q13972 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RASGRF1Q13972 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RASGRF1Q13972 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RASGRF1Q13972 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RASGRF1Q13972 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RASGRF1Q13972 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RASGRF1Q13972 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RASGRF1Q13972 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RASGRF1Q13972 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RASGRF1Q13972 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RASGRF1Q13972 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RASGRF1Q13972 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RASGRF1Q13972 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RASGRF1Q13972 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RASGRF1Q13972 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RASGRF1Q13972 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RASGRF1Q13972 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RASGRF1Q13972 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RASGRF1Q13972 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
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