Protein–RNA interactions for Protein: Q13613

MTMR1, Myotubularin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1Q13613 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MTMR1Q13613 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTMR1Q13613 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MTMR1Q13613 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MTMR1Q13613 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTMR1Q13613 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MTMR1Q13613 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTMR1Q13613 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTMR1Q13613 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTMR1Q13613 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MTMR1Q13613 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTMR1Q13613 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTMR1Q13613 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MTMR1Q13613 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MTMR1Q13613 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MTMR1Q13613 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTMR1Q13613 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTMR1Q13613 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MTMR1Q13613 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTMR1Q13613 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTMR1Q13613 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTMR1Q13613 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTMR1Q13613 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MTMR1Q13613 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTMR1Q13613 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTMR1Q13613 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTMR1Q13613 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTMR1Q13613 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTMR1Q13613 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTMR1Q13613 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTMR1Q13613 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTMR1Q13613 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTMR1Q13613 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR1Q13613 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR1Q13613 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTMR1Q13613 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
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