Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 ARID1A-202ENST00000374152 6460 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.589e-7■■■□□ 18
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G3BP1Q13283 PSMA4-215ENST00000559934 2741 ntTSL 1 (best)25.71■■□□□ 1.712e-6■■■□□ 18
G3BP1Q13283 PSMA4-218ENST00000560099 2596 ntTSL 224.68■■□□□ 1.542e-6■■■□□ 18
G3BP1Q13283 PSMA4-219ENST00000560217 944 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.092e-6■■■□□ 18
G3BP1Q13283 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.262e-6■■■□□ 18
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G3BP1Q13283 PSMA4-220ENST00000560737 815 ntTSL 54.85□□□□□ -1.632e-6■■■□□ 18
G3BP1Q13283 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.72e-6■■■□□ 18
G3BP1Q13283 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.772e-6■■■□□ 18
G3BP1Q13283 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.922e-6■■■□□ 18
G3BP1Q13283 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.952e-6■■■□□ 18
G3BP1Q13283 PSMA5-204ENST00000490870 1667 ntTSL 1 (best)12.7□□□□□ -0.383e-7■■■□□ 18
G3BP1Q13283 PSMA5-206ENST00000538610 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.63e-7■■■□□ 18
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G3BP1Q13283 GLDC-218ENST00000639954 3279 ntTSL 58.48□□□□□ -1.051e-6■■■□□ 18
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G3BP1Q13283 PCCB-202ENST00000459873 534 ntTSL 411.33□□□□□ -0.63e-6■■■□□ 18
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G3BP1Q13283 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.682e-7■■■□□ 18
G3BP1Q13283 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.662e-7■■■□□ 18
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G3BP1Q13283 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.382e-7■■■□□ 18
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G3BP1Q13283 SHMT2-226ENST00000556825 2215 ntTSL 1 (best)15.67■□□□□ 0.12e-7■■■□□ 18
G3BP1Q13283 SHMT2-205ENST00000553474 1765 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.082e-7■■■□□ 18
G3BP1Q13283 SHMT2-229ENST00000557348 1659 ntTSL 215.46■□□□□ 0.072e-7■■■□□ 18
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G3BP1Q13283 SHMT2-212ENST00000554467 3416 ntTSL 214.25□□□□□ -0.132e-7■■■□□ 18
G3BP1Q13283 SHMT2-201ENST00000328923 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.292e-7■■■□□ 18
G3BP1Q13283 ADH5-212ENST00000512991 880 ntTSL 513.21□□□□□ -0.298e-8■■■□□ 18
G3BP1Q13283 UTRN-211ENST00000465299 372 ntTSL 513.1□□□□□ -0.311e-12■■■□□ 18
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G3BP1Q13283 APEH-207ENST00000449966 825 ntTSL 320.38■□□□□ 0.854e-6■■■□□ 17.9
G3BP1Q13283 APEH-203ENST00000442186 924 ntTSL 520.38■□□□□ 0.854e-6■■■□□ 17.9
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G3BP1Q13283 PPP2R1A-202ENST00000391791 979 ntTSL 222.05■■□□□ 1.122e-9■■■□□ 17.9
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G3BP1Q13283 NUP98-206ENST00000397013 939 ntTSL 59.84□□□□□ -0.834e-6■■■□□ 17.9
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G3BP1Q13283 HSPA8-211ENST00000527983 1509 ntTSL 1 (best)14.46□□□□□ -0.13e-8■■■□□ 17.9
G3BP1Q13283 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.75e-6■■■□□ 17.9
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G3BP1Q13283 ARID1A-206ENST00000466382 2699 ntTSL 215.1■□□□□ 0.011e-6■■■□□ 17.9
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G3BP1Q13283 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.921e-6■■■□□ 17.9
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G3BP1Q13283 ECI1-206ENST00000566379 961 ntTSL 227.26■■□□□ 1.951e-6■■■□□ 17.9
G3BP1Q13283 DCTN1-225ENST00000497666 479 ntTSL 319.97■□□□□ 0.794e-7■■■□□ 17.8
G3BP1Q13283 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.451e-7■■■□□ 17.8
G3BP1Q13283 ADH5-210ENST00000512621 1475 ntTSL 215.38■□□□□ 0.051e-7■■■□□ 17.8
G3BP1Q13283 ADH5-201ENST00000296412 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.651e-7■■■□□ 17.8
G3BP1Q13283 EFTUD2-214ENST00000589769 689 ntTSL 318.68■□□□□ 0.582e-6■■■□□ 17.8
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G3BP1Q13283 ATP5O-205ENST00000431254 583 ntTSL 211.94□□□□□ -0.52e-7■■■□□ 17.8
G3BP1Q13283 ATP5O-201ENST00000290299 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.532e-7■■■□□ 17.8
G3BP1Q13283 AP000311.1-201ENST00000429238 1078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.572e-7■■■□□ 17.8
G3BP1Q13283 HSPA8-212ENST00000528292 1112 ntTSL 27.55□□□□□ -1.23e-8■■■□□ 17.8
G3BP1Q13283 BOD1L1-201ENST00000040738 10565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.43e-6■■■□□ 17.8
G3BP1Q13283 EIF4A1-204ENST00000577731 574 ntTSL 23.93□□□□□ -1.787e-15■■■□□ 17.8
G3BP1Q13283 PLCG1-219ENST00000612731 544 ntTSL 315.46■□□□□ 0.072e-7■■■□□ 17.8
G3BP1Q13283 DDX3X-212ENST00000616050 818 ntTSL 513.54□□□□□ -0.241e-6■■■□□ 17.8
G3BP1Q13283 QARS-242ENST00000635443 1053 ntTSL 516.46■□□□□ 0.233e-7■■■□□ 17.8
G3BP1Q13283 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.531e-7■■■□□ 17.8
G3BP1Q13283 IDH1-203ENST00000415913 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.261e-7■■■□□ 17.8
G3BP1Q13283 DARS-205ENST00000449218 543 ntTSL 38.66□□□□□ -1.022e-7■■■□□ 17.8
G3BP1Q13283 SCRN1-209ENST00000494620 553 ntTSL 413.66□□□□□ -0.221e-10■■■□□ 17.8
G3BP1Q13283 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.291e-6■■■□□ 17.8
G3BP1Q13283 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.791e-6■■■□□ 17.8
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