Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMA3BQ13214 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEMA3BQ13214 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMA3BQ13214 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
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