Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DUSP4Q13115 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DUSP4Q13115 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DUSP4Q13115 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
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