Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPS1Q13098 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPS1Q13098 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
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