Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNMA1Q12791 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCNMA1Q12791 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms