Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAPQ12770 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCAPQ12770 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCAPQ12770 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
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