Protein–RNA interactions for Protein: Q08380

LGALS3BP, Galectin-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS3BPQ08380 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LGALS3BPQ08380 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LGALS3BPQ08380 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LGALS3BPQ08380 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LGALS3BPQ08380 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LGALS3BPQ08380 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LGALS3BPQ08380 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LGALS3BPQ08380 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LGALS3BPQ08380 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LGALS3BPQ08380 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LGALS3BPQ08380 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LGALS3BPQ08380 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LGALS3BPQ08380 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LGALS3BPQ08380 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LGALS3BPQ08380 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LGALS3BPQ08380 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LGALS3BPQ08380 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LGALS3BPQ08380 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LGALS3BPQ08380 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LGALS3BPQ08380 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LGALS3BPQ08380 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LGALS3BPQ08380 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LGALS3BPQ08380 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LGALS3BPQ08380 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LGALS3BPQ08380 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LGALS3BPQ08380 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LGALS3BPQ08380 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LGALS3BPQ08380 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LGALS3BPQ08380 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LGALS3BPQ08380 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LGALS3BPQ08380 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LGALS3BPQ08380 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LGALS3BPQ08380 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LGALS3BPQ08380 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LGALS3BPQ08380 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
LGALS3BPQ08380 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
LGALS3BPQ08380 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LGALS3BPQ08380 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LGALS3BPQ08380 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LGALS3BPQ08380 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LGALS3BPQ08380 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LGALS3BPQ08380 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms