Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TGM3Q08188 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TGM3Q08188 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGM3Q08188 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms