Protein–RNA interactions for Protein: Q06623

HDA3, HDA1 complex subunit 3, yeastyeast

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3Q06623 YOR389WYOR389W 1875 nt6.71□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 KIN28YDL108W 921 nt6.71□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 COQ4YDR204W 1008 nt6.71□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 DAM1YGR113W 1032 nt6.71□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 ECM14YHR132C 1293 nt6.71□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 AUR1YKL004W 1206 nt6.71□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 COS9YKL219W 1224 nt6.71□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 SNO4YMR322C 714 nt6.71□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 MPP6YNR024W 561 nt6.71□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt6.71□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 HSP33YOR391C 714 nt6.71□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 YPL257WYPL257W 582 nt6.71□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 HSP32YPL280W 714 nt6.71□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt6.71□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 YFR006WYFR006W 1608 nt6.71□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 GAS5YOL030W 1455 nt6.71□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 SLA2YNL243W 2907 nt6.7□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 KTR7YIL085C 1554 nt6.7□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 VTS1YOR359W 1572 nt6.7□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 YPR196WYPR196W 1413 nt6.7□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 MRPS28YDR337W 861 nt6.7□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.7□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 YGR079WYGR079W 1113 nt6.7□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 BET4YJL031C 984 nt6.7□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 SWD2YKL018W 990 nt6.7□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt6.7□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 VPS71YML041C 843 nt6.7□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt6.7□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 ADD37YMR184W 597 nt6.7□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 YNR061CYNR061C 660 nt6.7□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 snR11snR11 258 nt6.7□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 LGE1YPL055C 999 nt6.7□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 KTR6YPL053C 1341 nt6.7□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 YTM1YOR272W 1383 nt6.69□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 SMP1YBR182C 1359 nt6.69□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 ADY3YDL239C 2373 nt6.69□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 NUP49YGL172W 1419 nt6.69□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 ACF2YLR144C 2340 nt6.69□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 MRPL7YDR237W 879 nt6.69□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 YGL102CYGL102C 429 nt6.69□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 UPF3YGR072W 1164 nt6.69□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 YIL163CYIL163C 354 nt6.69□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 ARG1YOL058W 1263 nt6.69□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 ATG34YOL083W 1239 nt6.69□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 NPT1YOR209C 1290 nt6.69□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 SPE3YPR069C 882 nt6.69□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 MIG1YGL035C 1515 nt6.69□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 PRP2YNR011C 2631 nt6.69□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 PRM2YIL037C 1971 nt6.69□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 RAD59YDL059C 717 nt6.68□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 YDL177CYDL177C 513 nt6.68□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt6.68□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 LIN1YHR156C 1023 nt6.68□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 LNP1YHR192W 837 nt6.68□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 SYS1YJL004C 612 nt6.68□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 PFK27YOL136C 1194 nt6.68□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 KTR1YOR099W 1182 nt6.68□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 VPS4YPR173C 1314 nt6.68□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 SPT14YPL175W 1359 nt6.68□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 CNA1YLR433C 1662 nt6.68□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 NSI1YDR026C 1713 nt6.67□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 DAS2YDR020C 699 nt6.67□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 DON1YDR273W 1098 nt6.67□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 SRB5YGR104C 924 nt6.67□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 ATP19YOL077W-A 207 nt6.67□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 RPL5YPL131W 894 nt6.67□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 OPI11YPR044C 354 nt6.67□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 SMX3YPR182W 261 nt6.67□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 GYP1YOR070C 1914 nt6.67□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 SEC18YBR080C 2277 nt6.67□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 PEX31YGR004W 1389 nt6.67□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 IXR1YKL032C 1794 nt6.67□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 ICP55YER078C 1536 nt6.66□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 NPY1YGL067W 1155 nt6.66□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 TAN1YGL232W 870 nt6.66□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 YGR042WYGR042W 816 nt6.66□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 PRS3YHL011C 963 nt6.66□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 DYS1YHR068W 1164 nt6.66□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 DUS4YLR405W 1104 nt6.66□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 SEN15YMR059W 387 nt6.66□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt6.66□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 RCL1YOL010W 1104 nt6.66□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 RER2YBR002C 861 nt6.66□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 SGT1YOR057W 1188 nt6.66□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 SPO1YNL012W 1896 nt6.66□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 RGL1YPL066W 1440 nt6.66□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 PLB3YOL011W 2061 nt6.65□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 MHF2YDL160C-A 243 nt6.65□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 YEL010WYEL010W 351 nt6.65□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 RTR1YER139C 681 nt6.65□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 YGL117WYGL117W 798 nt6.65□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 MNN11YJL183W 1269 nt6.65□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 PNT1YOR266W 1272 nt6.65□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 SEC62YPL094C 825 nt6.65□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 RRG8YPR116W 834 nt6.65□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 SPP381YBR152W 876 nt6.65□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 RPS9BYBR189W 588 nt6.65□□□□□ -1.34
HDA3Q06623 RPT2YDL007W 1314 nt6.65□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 ALG9YNL219C 1668 nt6.65□□□□□ -1.35
HDA3Q06623 MSC3YLR219W 2187 nt6.64□□□□□ -1.35
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