Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EXOSC9Q06265 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EXOSC9Q06265 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EXOSC9Q06265 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EXOSC9Q06265 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms