Protein–RNA interactions for Protein: Q04759

PRKCQ, Protein kinase C theta type, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQQ04759 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKCQQ04759 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKCQQ04759 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKCQQ04759 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms