Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC39.76■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
ERCC6Q03468 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
ERCC6Q03468 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
ERCC6Q03468 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
ERCC6Q03468 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
ERCC6Q03468 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
ERCC6Q03468 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
ERCC6Q03468 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
ERCC6Q03468 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
ERCC6Q03468 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
ERCC6Q03468 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
ERCC6Q03468 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
ERCC6Q03468 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
ERCC6Q03468 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
ERCC6Q03468 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
ERCC6Q03468 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
ERCC6Q03468 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
ERCC6Q03468 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
ERCC6Q03468 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
ERCC6Q03468 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
ERCC6Q03468 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
ERCC6Q03468 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
ERCC6Q03468 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
ERCC6Q03468 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
ERCC6Q03468 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
ERCC6Q03468 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
ERCC6Q03468 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC39.71■■■■□ 3.95
ERCC6Q03468 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
ERCC6Q03468 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
ERCC6Q03468 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
ERCC6Q03468 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
ERCC6Q03468 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
ERCC6Q03468 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
ERCC6Q03468 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
ERCC6Q03468 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
ERCC6Q03468 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
ERCC6Q03468 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
ERCC6Q03468 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
ERCC6Q03468 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
ERCC6Q03468 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC39.68■■■■□ 3.94
ERCC6Q03468 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
ERCC6Q03468 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
ERCC6Q03468 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC39.66■■■■□ 3.94
ERCC6Q03468 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.66■■■■□ 3.94
ERCC6Q03468 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
ERCC6Q03468 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
ERCC6Q03468 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
ERCC6Q03468 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
ERCC6Q03468 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC39.65■■■■□ 3.94
ERCC6Q03468 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
ERCC6Q03468 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
ERCC6Q03468 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
ERCC6Q03468 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
ERCC6Q03468 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
ERCC6Q03468 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
ERCC6Q03468 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
ERCC6Q03468 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
ERCC6Q03468 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.94
ERCC6Q03468 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
ERCC6Q03468 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.94
ERCC6Q03468 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.94
ERCC6Q03468 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
ERCC6Q03468 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
ERCC6Q03468 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
ERCC6Q03468 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC39.62■■■■□ 3.93
ERCC6Q03468 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
ERCC6Q03468 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.61■■■■□ 3.93
ERCC6Q03468 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
ERCC6Q03468 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
ERCC6Q03468 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
ERCC6Q03468 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
ERCC6Q03468 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
ERCC6Q03468 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
ERCC6Q03468 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
ERCC6Q03468 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
ERCC6Q03468 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
ERCC6Q03468 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
ERCC6Q03468 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
ERCC6Q03468 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
ERCC6Q03468 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
ERCC6Q03468 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
ERCC6Q03468 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC39.58■■■■□ 3.93
ERCC6Q03468 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
ERCC6Q03468 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC39.57■■■■□ 3.93
ERCC6Q03468 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC39.57■■■■□ 3.93
ERCC6Q03468 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC39.57■■■■□ 3.93
ERCC6Q03468 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.93
ERCC6Q03468 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
ERCC6Q03468 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC39.56■■■■□ 3.92
ERCC6Q03468 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
ERCC6Q03468 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
ERCC6Q03468 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
ERCC6Q03468 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
ERCC6Q03468 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
ERCC6Q03468 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
ERCC6Q03468 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
ERCC6Q03468 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
ERCC6Q03468 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC39.54■■■■□ 3.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms