Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GCNT1Q02742 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms