Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NHLH2Q02577 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NHLH2Q02577 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms