Protein–RNA interactions for Protein: Q02221

COX6A2, Cytochrome c oxidase subunit 6A2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A2Q02221 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A2Q02221 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A2Q02221 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A2Q02221 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A2Q02221 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A2Q02221 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A2Q02221 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A2Q02221 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A2Q02221 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A2Q02221 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A2Q02221 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A2Q02221 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A2Q02221 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A2Q02221 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A2Q02221 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A2Q02221 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A2Q02221 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A2Q02221 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A2Q02221 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A2Q02221 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A2Q02221 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX6A2Q02221 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX6A2Q02221 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX6A2Q02221 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX6A2Q02221 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX6A2Q02221 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX6A2Q02221 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX6A2Q02221 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX6A2Q02221 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX6A2Q02221 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX6A2Q02221 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX6A2Q02221 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX6A2Q02221 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COX6A2Q02221 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms