Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SPIBQ01892 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPIBQ01892 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms