Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MS4A2Q01362 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MS4A2Q01362 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MS4A2Q01362 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms