Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKB2Q00653 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NFKB2Q00653 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NFKB2Q00653 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms