Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PITPNAQ00169 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PITPNAQ00169 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PITPNAQ00169 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PITPNAQ00169 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PITPNAQ00169 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PITPNAQ00169 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PITPNAQ00169 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PITPNAQ00169 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PITPNAQ00169 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PITPNAQ00169 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PITPNAQ00169 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PITPNAQ00169 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PITPNAQ00169 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PITPNAQ00169 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PITPNAQ00169 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PITPNAQ00169 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PITPNAQ00169 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PITPNAQ00169 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PITPNAQ00169 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PITPNAQ00169 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PITPNAQ00169 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PITPNAQ00169 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PITPNAQ00169 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PITPNAQ00169 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PITPNAQ00169 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PITPNAQ00169 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PITPNAQ00169 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PITPNAQ00169 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PITPNAQ00169 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PITPNAQ00169 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PITPNAQ00169 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PITPNAQ00169 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PITPNAQ00169 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PITPNAQ00169 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms