Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRX1P78414 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX1P78414 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX1P78414 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX1P78414 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX1P78414 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX1P78414 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX1P78414 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX1P78414 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRX1P78414 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRX1P78414 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRX1P78414 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRX1P78414 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRX1P78414 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRX1P78414 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IRX1P78414 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX1P78414 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX1P78414 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX1P78414 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX1P78414 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX1P78414 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX1P78414 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX1P78414 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX1P78414 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX1P78414 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX1P78414 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX1P78414 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX1P78414 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IRX1P78414 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX1P78414 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX1P78414 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX1P78414 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX1P78414 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX1P78414 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX1P78414 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX1P78414 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX1P78414 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRX1P78414 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX1P78414 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX1P78414 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX1P78414 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX1P78414 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX1P78414 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX1P78414 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX1P78414 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX1P78414 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX1P78414 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX1P78414 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX1P78414 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX1P78414 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX1P78414 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRX1P78414 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX1P78414 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX1P78414 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX1P78414 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX1P78414 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX1P78414 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX1P78414 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX1P78414 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX1P78414 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX1P78414 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRX1P78414 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX1P78414 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX1P78414 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX1P78414 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX1P78414 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX1P78414 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX1P78414 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX1P78414 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX1P78414 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX1P78414 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRX1P78414 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX1P78414 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX1P78414 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX1P78414 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX1P78414 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX1P78414 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX1P78414 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX1P78414 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX1P78414 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX1P78414 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX1P78414 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX1P78414 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX1P78414 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX1P78414 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX1P78414 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRX1P78414 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX1P78414 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX1P78414 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX1P78414 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX1P78414 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX1P78414 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX1P78414 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX1P78414 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX1P78414 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX1P78414 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRX1P78414 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRX1P78414 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRX1P78414 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
IRX1P78414 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms