Protein–RNA interactions for Protein: P62750

RPL23A, 60S ribosomal protein L23a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP62750 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL23AP62750 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL23AP62750 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms