Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB2AP61019 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB2AP61019 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB2AP61019 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB2AP61019 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB2AP61019 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB2AP61019 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB2AP61019 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB2AP61019 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB2AP61019 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB2AP61019 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB2AP61019 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB2AP61019 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB2AP61019 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB2AP61019 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB2AP61019 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB2AP61019 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB2AP61019 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB2AP61019 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB2AP61019 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB2AP61019 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB2AP61019 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB2AP61019 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB2AP61019 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB2AP61019 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB2AP61019 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB2AP61019 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB2AP61019 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms