Protein–RNA interactions for Protein: P60484

PTEN, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP60484 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTENP60484 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTENP60484 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTENP60484 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTENP60484 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTENP60484 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTENP60484 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTENP60484 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTENP60484 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTENP60484 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTENP60484 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PTENP60484 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTENP60484 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTENP60484 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PTENP60484 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTENP60484 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTENP60484 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTENP60484 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTENP60484 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTENP60484 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTENP60484 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTENP60484 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTENP60484 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTENP60484 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTENP60484 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTENP60484 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTENP60484 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTENP60484 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTENP60484 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTENP60484 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTENP60484 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTENP60484 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PTENP60484 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTENP60484 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTENP60484 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTENP60484 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTENP60484 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTENP60484 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTENP60484 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTENP60484 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTENP60484 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTENP60484 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTENP60484 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTENP60484 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTENP60484 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTENP60484 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTENP60484 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTENP60484 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTENP60484 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTENP60484 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTENP60484 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTENP60484 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTENP60484 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTENP60484 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTENP60484 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTENP60484 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTENP60484 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTENP60484 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTENP60484 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTENP60484 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTENP60484 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTENP60484 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTENP60484 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTENP60484 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTENP60484 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTENP60484 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTENP60484 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTENP60484 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTENP60484 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTENP60484 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTENP60484 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTENP60484 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTENP60484 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTENP60484 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTENP60484 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTENP60484 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTENP60484 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTENP60484 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTENP60484 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTENP60484 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTENP60484 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTENP60484 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTENP60484 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTENP60484 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTENP60484 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTENP60484 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTENP60484 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTENP60484 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTENP60484 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTENP60484 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTENP60484 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTENP60484 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTENP60484 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTENP60484 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTENP60484 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTENP60484 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTENP60484 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTENP60484 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTENP60484 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTENP60484 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms