Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX16P57768 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX16P57768 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX16P57768 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX16P57768 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX16P57768 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX16P57768 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX16P57768 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX16P57768 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX16P57768 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX16P57768 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX16P57768 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX16P57768 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX16P57768 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX16P57768 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX16P57768 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX16P57768 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX16P57768 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX16P57768 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX16P57768 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX16P57768 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX16P57768 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX16P57768 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX16P57768 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX16P57768 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX16P57768 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX16P57768 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX16P57768 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX16P57768 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX16P57768 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX16P57768 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX16P57768 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX16P57768 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX16P57768 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX16P57768 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX16P57768 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX16P57768 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX16P57768 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX16P57768 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX16P57768 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX16P57768 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX16P57768 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX16P57768 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX16P57768 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX16P57768 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX16P57768 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX16P57768 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX16P57768 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX16P57768 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX16P57768 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX16P57768 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX16P57768 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX16P57768 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX16P57768 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX16P57768 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX16P57768 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX16P57768 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX16P57768 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX16P57768 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX16P57768 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX16P57768 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX16P57768 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX16P57768 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX16P57768 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX16P57768 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX16P57768 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX16P57768 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX16P57768 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX16P57768 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX16P57768 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX16P57768 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX16P57768 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX16P57768 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX16P57768 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX16P57768 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX16P57768 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX16P57768 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX16P57768 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX16P57768 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX16P57768 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX16P57768 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX16P57768 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX16P57768 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX16P57768 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX16P57768 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX16P57768 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX16P57768 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX16P57768 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX16P57768 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX16P57768 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX16P57768 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX16P57768 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX16P57768 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX16P57768 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX16P57768 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX16P57768 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX16P57768 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNX16P57768 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX16P57768 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX16P57768 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms