Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HDAC4P56524 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HDAC4P56524 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms