Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3BP55884 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3BP55884 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms