Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CASP7P55210 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CASP7P55210 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CASP7P55210 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CASP7P55210 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CASP7P55210 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CASP7P55210 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CASP7P55210 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CASP7P55210 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CASP7P55210 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CASP7P55210 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CASP7P55210 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CASP7P55210 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CASP7P55210 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CASP7P55210 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CASP7P55210 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CASP7P55210 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CASP7P55210 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CASP7P55210 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CASP7P55210 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CASP7P55210 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CASP7P55210 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CASP7P55210 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASP7P55210 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASP7P55210 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASP7P55210 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASP7P55210 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CASP7P55210 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASP7P55210 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASP7P55210 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASP7P55210 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASP7P55210 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASP7P55210 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASP7P55210 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASP7P55210 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASP7P55210 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASP7P55210 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CASP7P55210 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CASP7P55210 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CASP7P55210 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CASP7P55210 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CASP7P55210 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CASP7P55210 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CASP7P55210 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CASP7P55210 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CASP7P55210 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CASP7P55210 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CASP7P55210 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CASP7P55210 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CASP7P55210 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CASP7P55210 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CASP7P55210 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CASP7P55210 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CASP7P55210 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CASP7P55210 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CASP7P55210 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CASP7P55210 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CASP7P55210 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CASP7P55210 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CASP7P55210 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CASP7P55210 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CASP7P55210 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CASP7P55210 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CASP7P55210 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CASP7P55210 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CASP7P55210 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CASP7P55210 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CASP7P55210 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CASP7P55210 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CASP7P55210 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CASP7P55210 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CASP7P55210 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CASP7P55210 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CASP7P55210 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CASP7P55210 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CASP7P55210 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CASP7P55210 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CASP7P55210 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CASP7P55210 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CASP7P55210 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASP7P55210 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASP7P55210 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CASP7P55210 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASP7P55210 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASP7P55210 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASP7P55210 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASP7P55210 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CASP7P55210 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CASP7P55210 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CASP7P55210 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CASP7P55210 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASP7P55210 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASP7P55210 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASP7P55210 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASP7P55210 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASP7P55210 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASP7P55210 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASP7P55210 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASP7P55210 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASP7P55210 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms