Protein–RNA interactions for Protein: P55072

VCP, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPP55072 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VCPP55072 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VCPP55072 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VCPP55072 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VCPP55072 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VCPP55072 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VCPP55072 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VCPP55072 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VCPP55072 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VCPP55072 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VCPP55072 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VCPP55072 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VCPP55072 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VCPP55072 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VCPP55072 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VCPP55072 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VCPP55072 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VCPP55072 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VCPP55072 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VCPP55072 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VCPP55072 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VCPP55072 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VCPP55072 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VCPP55072 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VCPP55072 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VCPP55072 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VCPP55072 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VCPP55072 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VCPP55072 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VCPP55072 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VCPP55072 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VCPP55072 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VCPP55072 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VCPP55072 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VCPP55072 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VCPP55072 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
VCPP55072 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VCPP55072 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VCPP55072 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VCPP55072 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VCPP55072 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VCPP55072 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VCPP55072 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VCPP55072 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VCPP55072 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VCPP55072 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VCPP55072 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VCPP55072 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VCPP55072 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VCPP55072 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VCPP55072 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VCPP55072 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VCPP55072 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VCPP55072 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VCPP55072 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VCPP55072 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VCPP55072 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VCPP55072 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VCPP55072 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VCPP55072 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VCPP55072 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VCPP55072 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
VCPP55072 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VCPP55072 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VCPP55072 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VCPP55072 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VCPP55072 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VCPP55072 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VCPP55072 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VCPP55072 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VCPP55072 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VCPP55072 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VCPP55072 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VCPP55072 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VCPP55072 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VCPP55072 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VCPP55072 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VCPP55072 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VCPP55072 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VCPP55072 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VCPP55072 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VCPP55072 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VCPP55072 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VCPP55072 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VCPP55072 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VCPP55072 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VCPP55072 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VCPP55072 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VCPP55072 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VCPP55072 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VCPP55072 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VCPP55072 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VCPP55072 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VCPP55072 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VCPP55072 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VCPP55072 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VCPP55072 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VCPP55072 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VCPP55072 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VCPP55072 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms