Protein–RNA interactions for Protein: P55017

SLC12A3, Solute carrier family 12 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A3P55017 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC12A3P55017 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC12A3P55017 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC12A3P55017 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms