Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP1B3P54709 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1B3P54709 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1B3P54709 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1B3P54709 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1B3P54709 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1B3P54709 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1B3P54709 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1B3P54709 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1B3P54709 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1B3P54709 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1B3P54709 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1B3P54709 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP1B3P54709 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP1B3P54709 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP1B3P54709 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP1B3P54709 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms