Protein–RNA interactions for Protein: P53990

IST1, IST1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IST1P53990 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IST1P53990 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IST1P53990 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IST1P53990 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IST1P53990 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IST1P53990 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IST1P53990 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IST1P53990 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IST1P53990 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IST1P53990 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IST1P53990 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IST1P53990 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IST1P53990 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IST1P53990 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IST1P53990 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IST1P53990 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IST1P53990 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IST1P53990 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IST1P53990 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IST1P53990 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
IST1P53990 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IST1P53990 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IST1P53990 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IST1P53990 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
IST1P53990 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IST1P53990 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
IST1P53990 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IST1P53990 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IST1P53990 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IST1P53990 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IST1P53990 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IST1P53990 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IST1P53990 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IST1P53990 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IST1P53990 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IST1P53990 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IST1P53990 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IST1P53990 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IST1P53990 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IST1P53990 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IST1P53990 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IST1P53990 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IST1P53990 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IST1P53990 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IST1P53990 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IST1P53990 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IST1P53990 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IST1P53990 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IST1P53990 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IST1P53990 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IST1P53990 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IST1P53990 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IST1P53990 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IST1P53990 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IST1P53990 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IST1P53990 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IST1P53990 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IST1P53990 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IST1P53990 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IST1P53990 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IST1P53990 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IST1P53990 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IST1P53990 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IST1P53990 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IST1P53990 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
IST1P53990 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IST1P53990 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IST1P53990 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IST1P53990 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IST1P53990 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IST1P53990 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IST1P53990 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IST1P53990 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IST1P53990 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IST1P53990 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IST1P53990 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IST1P53990 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IST1P53990 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IST1P53990 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IST1P53990 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IST1P53990 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IST1P53990 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IST1P53990 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IST1P53990 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IST1P53990 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IST1P53990 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IST1P53990 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IST1P53990 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IST1P53990 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IST1P53990 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IST1P53990 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IST1P53990 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IST1P53990 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IST1P53990 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IST1P53990 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IST1P53990 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IST1P53990 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IST1P53990 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IST1P53990 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IST1P53990 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms