Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LUMP51884 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LUMP51884 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LUMP51884 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LUMP51884 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LUMP51884 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LUMP51884 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LUMP51884 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LUMP51884 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LUMP51884 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LUMP51884 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LUMP51884 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LUMP51884 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LUMP51884 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LUMP51884 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LUMP51884 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LUMP51884 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LUMP51884 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LUMP51884 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LUMP51884 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LUMP51884 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LUMP51884 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LUMP51884 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LUMP51884 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LUMP51884 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LUMP51884 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LUMP51884 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LUMP51884 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LUMP51884 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LUMP51884 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LUMP51884 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LUMP51884 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LUMP51884 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LUMP51884 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LUMP51884 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LUMP51884 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LUMP51884 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LUMP51884 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LUMP51884 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LUMP51884 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LUMP51884 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LUMP51884 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LUMP51884 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LUMP51884 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LUMP51884 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LUMP51884 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LUMP51884 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LUMP51884 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LUMP51884 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LUMP51884 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LUMP51884 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LUMP51884 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LUMP51884 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LUMP51884 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LUMP51884 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LUMP51884 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LUMP51884 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LUMP51884 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LUMP51884 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LUMP51884 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LUMP51884 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LUMP51884 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LUMP51884 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LUMP51884 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LUMP51884 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LUMP51884 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LUMP51884 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LUMP51884 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LUMP51884 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LUMP51884 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LUMP51884 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LUMP51884 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LUMP51884 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LUMP51884 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LUMP51884 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LUMP51884 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LUMP51884 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LUMP51884 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LUMP51884 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LUMP51884 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LUMP51884 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LUMP51884 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LUMP51884 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LUMP51884 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LUMP51884 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LUMP51884 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LUMP51884 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LUMP51884 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LUMP51884 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LUMP51884 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LUMP51884 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LUMP51884 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LUMP51884 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LUMP51884 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LUMP51884 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LUMP51884 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LUMP51884 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LUMP51884 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LUMP51884 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LUMP51884 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms