Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DAP3P51398 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DAP3P51398 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DAP3P51398 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DAP3P51398 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DAP3P51398 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DAP3P51398 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DAP3P51398 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DAP3P51398 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DAP3P51398 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DAP3P51398 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DAP3P51398 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DAP3P51398 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DAP3P51398 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DAP3P51398 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DAP3P51398 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DAP3P51398 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DAP3P51398 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DAP3P51398 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DAP3P51398 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DAP3P51398 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DAP3P51398 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DAP3P51398 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DAP3P51398 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DAP3P51398 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DAP3P51398 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DAP3P51398 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DAP3P51398 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DAP3P51398 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DAP3P51398 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DAP3P51398 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DAP3P51398 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DAP3P51398 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DAP3P51398 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DAP3P51398 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DAP3P51398 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DAP3P51398 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DAP3P51398 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DAP3P51398 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DAP3P51398 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DAP3P51398 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DAP3P51398 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DAP3P51398 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DAP3P51398 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DAP3P51398 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DAP3P51398 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DAP3P51398 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DAP3P51398 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DAP3P51398 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DAP3P51398 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DAP3P51398 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DAP3P51398 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DAP3P51398 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DAP3P51398 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DAP3P51398 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DAP3P51398 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DAP3P51398 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DAP3P51398 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DAP3P51398 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DAP3P51398 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DAP3P51398 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DAP3P51398 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DAP3P51398 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DAP3P51398 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DAP3P51398 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DAP3P51398 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DAP3P51398 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DAP3P51398 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DAP3P51398 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DAP3P51398 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DAP3P51398 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DAP3P51398 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DAP3P51398 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DAP3P51398 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DAP3P51398 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DAP3P51398 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DAP3P51398 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DAP3P51398 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DAP3P51398 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DAP3P51398 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DAP3P51398 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DAP3P51398 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DAP3P51398 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DAP3P51398 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DAP3P51398 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DAP3P51398 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DAP3P51398 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DAP3P51398 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DAP3P51398 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DAP3P51398 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DAP3P51398 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DAP3P51398 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DAP3P51398 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DAP3P51398 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DAP3P51398 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DAP3P51398 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DAP3P51398 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DAP3P51398 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DAP3P51398 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DAP3P51398 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms