Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ETV1P50549 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ETV1P50549 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ETV1P50549 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ETV1P50549 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ETV1P50549 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ETV1P50549 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ETV1P50549 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ETV1P50549 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ETV1P50549 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ETV1P50549 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ETV1P50549 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ETV1P50549 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ETV1P50549 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ETV1P50549 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ETV1P50549 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ETV1P50549 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ETV1P50549 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ETV1P50549 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ETV1P50549 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ETV1P50549 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ETV1P50549 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ETV1P50549 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ETV1P50549 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ETV1P50549 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ETV1P50549 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ETV1P50549 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ETV1P50549 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ETV1P50549 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ETV1P50549 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ETV1P50549 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ETV1P50549 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ETV1P50549 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ETV1P50549 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ETV1P50549 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ETV1P50549 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ETV1P50549 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ETV1P50549 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ETV1P50549 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ETV1P50549 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ETV1P50549 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ETV1P50549 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ETV1P50549 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ETV1P50549 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ETV1P50549 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ETV1P50549 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ETV1P50549 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ETV1P50549 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ETV1P50549 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ETV1P50549 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ETV1P50549 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ETV1P50549 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ETV1P50549 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ETV1P50549 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ETV1P50549 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ETV1P50549 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ETV1P50549 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ETV1P50549 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ETV1P50549 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ETV1P50549 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ETV1P50549 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ETV1P50549 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ETV1P50549 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ETV1P50549 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ETV1P50549 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ETV1P50549 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ETV1P50549 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ETV1P50549 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ETV1P50549 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ETV1P50549 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ETV1P50549 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ETV1P50549 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ETV1P50549 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ETV1P50549 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ETV1P50549 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ETV1P50549 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ETV1P50549 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ETV1P50549 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ETV1P50549 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ETV1P50549 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ETV1P50549 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ETV1P50549 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ETV1P50549 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ETV1P50549 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ETV1P50549 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ETV1P50549 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ETV1P50549 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ETV1P50549 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ETV1P50549 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ETV1P50549 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ETV1P50549 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ETV1P50549 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ETV1P50549 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ETV1P50549 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ETV1P50549 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ETV1P50549 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ETV1P50549 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ETV1P50549 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ETV1P50549 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ETV1P50549 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms