Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VEGFBP49765 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
VEGFBP49765 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VEGFBP49765 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms