Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLK2P49760 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLK2P49760 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLK2P49760 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLK2P49760 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLK2P49760 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLK2P49760 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLK2P49760 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLK2P49760 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLK2P49760 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLK2P49760 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLK2P49760 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLK2P49760 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLK2P49760 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CLK2P49760 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLK2P49760 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLK2P49760 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLK2P49760 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLK2P49760 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLK2P49760 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLK2P49760 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLK2P49760 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLK2P49760 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLK2P49760 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLK2P49760 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLK2P49760 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLK2P49760 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CLK2P49760 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLK2P49760 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CLK2P49760 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLK2P49760 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLK2P49760 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLK2P49760 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLK2P49760 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLK2P49760 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLK2P49760 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLK2P49760 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLK2P49760 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLK2P49760 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLK2P49760 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CLK2P49760 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLK2P49760 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLK2P49760 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLK2P49760 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CLK2P49760 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLK2P49760 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLK2P49760 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLK2P49760 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CLK2P49760 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLK2P49760 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLK2P49760 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLK2P49760 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLK2P49760 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLK2P49760 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLK2P49760 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLK2P49760 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLK2P49760 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CLK2P49760 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLK2P49760 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CLK2P49760 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CLK2P49760 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CLK2P49760 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLK2P49760 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLK2P49760 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLK2P49760 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLK2P49760 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLK2P49760 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLK2P49760 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLK2P49760 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLK2P49760 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLK2P49760 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLK2P49760 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLK2P49760 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLK2P49760 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLK2P49760 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLK2P49760 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLK2P49760 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLK2P49760 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLK2P49760 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLK2P49760 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLK2P49760 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLK2P49760 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLK2P49760 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLK2P49760 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLK2P49760 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLK2P49760 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLK2P49760 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLK2P49760 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLK2P49760 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLK2P49760 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLK2P49760 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLK2P49760 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLK2P49760 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLK2P49760 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLK2P49760 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLK2P49760 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLK2P49760 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLK2P49760 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLK2P49760 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLK2P49760 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms